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        酵母雙雜實驗常見問題及解決方法下篇由普拉特澤生物技術(shù)為大家總結(jié)分享。本文是關(guān)于酵母雙雜實驗的最后一篇介紹，前面我們學(xué)習(xí)了什么是酵母雙雜、酵母雙雜實驗操作步驟、酵母雙雜注意事項以及酵母雙雜實操常見問題及處理的上篇，可以點擊標(biāo)題直接傳送回去學(xué)習(xí)的哦。普拉特澤生物分子檢測平臺承接酵母雙雜實驗外包上百例，早就為大家把實驗過程中要踩的雷、吃的虧幫大家吃完了，現(xiàn)在我們就來看看，實驗過程中還有哪些常見的問題和解決方法吧！
  前期回顧：
  什么是酵母雙雜？
  酵母雙雜交實驗詳細操作步驟
  酵母雙雜實驗操作注意事項
  酵母雙雜實驗常見問題及處理（上）

        問題一：.酵母轉(zhuǎn)化完成后可以用無菌水代替0.9%氯化鈉溶液重懸菌體嗎？

        可以的，生理鹽水重懸的目的是為了維持滲透壓，無菌水重懸酵母菌也可以，無菌水重懸后涂板和生理鹽水重懸后涂板，轉(zhuǎn)化效率并無明顯差異。

        問題二：如何降低酵母雙雜交系統(tǒng)中出現(xiàn)的假陽性？

        可以選擇多個篩選標(biāo)記進行更為嚴格的篩選，降低假陽性。

        問題三：誘餌蛋白是否一定需要自激活檢測？

        不一定，自激活檢測需要在Y2H Gold菌株中進行。主要作用有兩個，其一，需要根據(jù)誘餌蛋白自激活的程度調(diào)整AbA的濃度或3-AT的濃度；其二，檢測誘餌蛋白是否具有毒性，如果菌落生長過慢，可能表達的蛋白具有毒性，需要使用低拷貝的質(zhì)粒表達誘餌蛋白。

        問題四：AbA濃度對酵母菌篩選有什么影響？

        AbA用于篩選陽性克隆，雙雜常用濃度為100-200 ng/mL 。在陰性、陽性對照正常的前提下，如果篩選出來的陽性克隆數(shù)太少，可以將AbA濃度降至100ng/mL；如果篩選出來的陽性克隆數(shù)太多，排除自激活的前提下，相應(yīng)增加AbA的濃度。AbA的有效濃度也與接種量有關(guān)，如因接種量過多在含AbA的平板長出連成片的菌落，使得AbA無法達到有效作用效果。

        問題五：3-AT的篩選濃度怎么選擇，有沒有建議的使用濃度范圍？

        理想情況 10 mM濃度的3-AT平板會有少量生長，20 mM濃度的3-AT不能或極少生長。如果在80 mM濃度的3-AT平板上生長酵母，說明自激活活性太高，不能用于雙雜交篩選。

        問題六：誘餌蛋白具有自激活活性，能夠單獨激活報告基因的表達怎么辦？

        該蛋白如果是一個轉(zhuǎn)錄因子，具有轉(zhuǎn)錄激活域，需要去掉轉(zhuǎn)錄激活結(jié)構(gòu)域。如果不是轉(zhuǎn)錄因子但仍具有較強的轉(zhuǎn)錄激活活性，需要將誘餌蛋白具有激活活性的區(qū)域去除，進行后續(xù)操作，但這樣操作有可能影響蛋白間的互作。

        問題七：誘餌蛋白的大小是否對酵母雙雜交的結(jié)果有影響？

        雖然文獻報道從8-750個氨基酸都有成功的案例，但是分子量比較大的蛋白由于在酵母中可能存在折疊錯誤的情況，在實際工作中，分子量比較大的誘餌蛋白在酵母中尋找互作蛋白的成功率低于中等大小分子量的誘餌蛋白。

        問題八：酵母雙雜交如何選擇使用核體系還是膜體系文庫？

        如果誘餌蛋白定位在膜上，使用膜體系文庫；如果誘餌蛋白定位在細胞核則選擇核體系；如果誘餌蛋白具有跨膜區(qū)，可以考慮把跨膜區(qū)去除或者選用定位在胞內(nèi)的區(qū)域使用核體系進行篩庫，但有一定風(fēng)險。

        問題九：在酵母菌株中檢測不到誘餌蛋白的表達或者表達不完全，怎么辦？

        可能是酵母細胞的OD值太低，細胞數(shù)量少，導(dǎo)致誘餌蛋白量低，很難檢測到，可以增加液體培養(yǎng)量；另一種原因可能是誘餌蛋白包含大量的稀有密碼子，酵母很難進行翻譯，建議優(yōu)化氨基酸序列，合成一條由酵母細胞能夠識別的密碼子組成的編碼相同的氨基酸序列的核苷酸，有望大大提高誘餌蛋白在酵母細胞中的表達。

        問題十：四缺板上篩選到的陽性克隆可以直接拿菌液或酵母質(zhì)粒去測序嗎？

        不行，因為酵母質(zhì)粒拷貝數(shù)低，達不到測序濃度，所以需要將抽提出的質(zhì)粒轉(zhuǎn)到大腸桿菌培養(yǎng)后再測序。

        好啦，那關(guān)于酵母雙雜實驗的所有常見問題和解決方法我們就介紹完啦，如果您也對酵母雙雜感興趣準(zhǔn)備做這個實驗，可以參考咱們關(guān)于酵母雙雜實驗的介紹、步驟、注意事項與常見問題參考設(shè)計實驗方案哦，還有不懂的可以直接給客服留言，我們會在第一時間給到您回復(fù)的哦！