DNA pull-dwon實(shí)驗(yàn)介紹【pull dwon外包】
來(lái)源/作者:普拉特澤-生物醫(yī)學(xué)整體課題外包平臺(tái)
大家好!今天普拉特澤生物跟大家一起學(xué)習(xí)一個(gè)新的實(shí)驗(yàn),DNA pull-dwon實(shí)驗(yàn),實(shí)驗(yàn)介紹由普拉特澤生物分子檢測(cè)平臺(tái)總結(jié)分享,分子檢測(cè)平臺(tái)專業(yè)承接DNA pull-down實(shí)驗(yàn)外包,為廣大生物科研路上的研究人提供實(shí)驗(yàn)上的幫助。
DNA Pull down實(shí)驗(yàn)是用脫硫生物素標(biāo)記特異性DNA探針,脫硫生物素探針可以和偶聯(lián)在磁珠上的鏈霉親和素親和結(jié)合。提取物與磁珠-DNA探針?lè)跤?,作用蛋白質(zhì)分子可以和DNA探針特異性結(jié)合;經(jīng)過(guò)洗滌可以將非特異性結(jié)合蛋白質(zhì)去除;用 Western Blot或質(zhì)譜對(duì)產(chǎn)物進(jìn)行檢測(cè)分析。
一、實(shí)驗(yàn)流程
一般來(lái)說(shuō),該實(shí)驗(yàn)首先,需要針對(duì)待研究目的基因的調(diào)控區(qū)域設(shè)計(jì)并制備特異性探針(以脫硫生物素標(biāo)記為主流);同時(shí),制備細(xì)胞核提取物;將探針和核提取物共同孵育,DNA結(jié)合蛋白就會(huì)和靶向序列特異性結(jié)合;然后,通過(guò)親和素磁珠純化蛋白質(zhì)DNA復(fù)合物;最后針對(duì)獲得的蛋白,使用Western blot驗(yàn)證或者質(zhì)譜方式鑒定蛋白質(zhì)類型。
二、 DNA pull-down技術(shù)應(yīng)用
DNA pull-down以感興趣的DNA序列為探針,尋找與該序列結(jié)合的蛋白質(zhì),最常見(jiàn)的應(yīng)用是尋找某特定基因啟動(dòng)子區(qū)域的轉(zhuǎn)錄因子。
a. DNA Pull down WB,用于檢測(cè)目標(biāo)DNA序列與某樣本中的待測(cè)蛋白是否存在相互作用;
b. DNA Pull down MS,用于篩選目標(biāo)DNA序列與某樣本中的哪些蛋白具有相互作用。
三、RNA pulldown優(yōu)缺點(diǎn):
① 富集分析低豐度蛋白;
② 探針制備簡(jiǎn)便,周期短;
③ 獲得特異性蛋白與下游蛋白質(zhì)檢測(cè)技術(shù)兼容;
缺點(diǎn):
① 長(zhǎng)連探針往往存在非特異結(jié)合現(xiàn)象;
② 反應(yīng)條件要求無(wú)核酸酶;
③ 體外實(shí)驗(yàn),相對(duì)體內(nèi)實(shí)驗(yàn)存在一定弊端;
四、RNA pulldown實(shí)驗(yàn)步驟
1.探針設(shè)計(jì)及標(biāo)記
2.樣本前處理
3. Pull down
4.蛋白質(zhì)檢測(cè)-- Western blot
5.蛋白質(zhì)檢測(cè)-- MS
好啦,DNA pull-down實(shí)驗(yàn)就簡(jiǎn)單介紹到這里啦,結(jié)尾給大家簡(jiǎn)單介紹了一下實(shí)驗(yàn)的框架流程,下期根據(jù)這個(gè)流程給大家詳細(xì)分享DNA pull-down實(shí)驗(yàn)的詳細(xì)步驟,如果您也對(duì)DNA pull-down實(shí)驗(yàn)感興趣或有DNA pull-down外包的需求,歡迎選擇咱們普拉特澤生物!下期見(jiàn)~