Northern Blot印跡雜交?實(shí)驗(yàn)詳細(xì)操作步驟
來源/作者:普拉特澤-生物醫(yī)學(xué)整體課題外包平臺(tái)
Northern Blot印跡雜交實(shí)驗(yàn)操作步驟由普拉特澤生物總結(jié)分享,Northern Blot是一種將RNA從瓊脂糖凝膠中轉(zhuǎn)印到硝酸纖維素膜上的方法,普拉特澤生物分子檢測平臺(tái)專業(yè)承接Northern Blot實(shí)驗(yàn)外包代做服務(wù),實(shí)驗(yàn)真,周期短,值得信賴。
圖片來源《Feedback inhibition of L1 and alu retrotransposition through altered double strand break repair kinetics》
Northern Blot實(shí)驗(yàn)詳細(xì)操作步驟:
1、總RNA提取。
2、變性膠的制備:取瓊脂糖0.2g,加入DEPC H2O12.4 ml,加熱融化,于保溫狀態(tài)下加入5×甲醛凝膠電泳緩沖液4.0ml、37%甲醛3.6ml,混勻、制膠。待膠凝固后,置1×甲醛凝膠電泳緩沖液中預(yù)電泳5min。
3、樣品制備:取總RNA4.5μl(約20-30μg) ,加入5×甲醛凝膠電泳緩沖液 4.0μl、37%甲醛3.6μl、甲酰胺10μl,65℃溫育15min、冰浴5min。加入EB(1μg/μl)1μl、上樣緩沖液2μl。
4、電泳:上樣,50V電泳(電泳時(shí)間約2hr左右)。電泳結(jié)束后將膠塊置紫外燈下,觀察RNA的完整性,記錄18S、28S條帶的位置(離加樣孔的距離)。
5、將RNA從變性膠轉(zhuǎn)移到硝酸纖維素膜或尼龍膜:
① 按膠塊大小剪取膜一張,用DEPC水中浸濕后,置于20×SSC中浸泡1hr。剪去膜一角。將膠塊切去一角,并在20×SSC浸泡15min×2次。
② 用長和寬均大于凝膠的一塊有機(jī)玻璃板作為平臺(tái),將其放入大的干烤皿上,上面放一張Whatman 3MM濾紙,倒入20×SSC使液面略低于平臺(tái)表面,當(dāng)平臺(tái)上方的3MM濾紙濕透后,用玻棒趕出所有氣泡。
③ 將凝膠翻轉(zhuǎn)后置于平臺(tái)上濕潤的3MM濾紙中央,3MM濾紙和凝膠之間不能滯留氣泡。
④ 用Parafilm膜圍繞凝膠四周,以此作為屏障,阻止液體自液池直接流至膠上方的紙巾。
⑤ 在凝膠上方放置預(yù)先已浸濕的尼龍膜,排除膜與凝膠之間的氣泡。
⑥ 將二張已濕潤的、與凝膠大小相同的3MM濾紙置于膜的上方,排除濾紙與濾膜之間的氣泡。
⑦將一疊(5-8cm厚)略小于3MM濾紙的紙巾置于3MM濾紙的上方,并在紙巾上方放一塊玻璃,然后用一個(gè)重約500克的重物壓在玻璃板上。其目的是建立液體自液池經(jīng)凝膠向膜上行流路,以洗脫凝膠中的RNA并使 其聚集在膜上。
6、使上述RNA轉(zhuǎn)移持續(xù)進(jìn)行15hr左右。在轉(zhuǎn)膜過程中,當(dāng)紙巾浸濕后,應(yīng)更換新的紙巾。
7、轉(zhuǎn)移結(jié)束后,揭去凝膠上方的紙巾和3MM濾紙。將膜在6×SSC中浸泡5 min,以去除膜上殘留的凝膠。
8、將凝膠置紫外燈下,觀察膠塊上有無殘留的RNA。
9、膜置80℃,真空干烤1-2hr??靖珊蟮哪び盟芰洗芊猓?℃保存?zhèn)溆谩?/span>
10、探針標(biāo)記(Prime-a-Gene Labeling System, Promega公司):
① 取模板DNA 25ng于0.5ml離心管中,95-100℃變性5min,冰浴5min。
② dNTPmix的制備: 取dGTP 1μl、dATP 1μl、dTTP 1μl混勻。
③ 將下列反應(yīng)成份混合,加入上述微量離心管中:
dNTPmix 2.0μl
BSA(10mg/ml ) 2.0μl
5×buffer 10.0μl
Klenow 酶(5u/μl) 1.0μl
α-32P-dCTP 5.0μl
加入適量dd H2O使反應(yīng)總體積達(dá)50μl,輕輕混勻。室溫下反應(yīng)1hr。
11、預(yù)雜交:將膜的反面緊貼雜交瓶,加入預(yù)雜交液5ml,42℃預(yù)雜交3hr。
12、雜交:將變性的探針(95-100℃變性5min,冰浴5min)加入到預(yù)雜交液中,42℃雜交16hr。
13、洗膜:
① 倒去雜交液。
② 2×SSC/0.1%SDS室溫洗15min。
③ 0.2×SSC/0.1%SDS,55℃洗15min×2次。
14、壓片:將膜用ddH2O漂洗片刻,用濾紙吸去膜上水份。用薄型塑料紙將膜包好,置于暗盒中,在暗室中壓上X光片。暗盒置-70℃放射自顯影3~7天左右
好啦,Northern Blot實(shí)驗(yàn)的詳細(xì)操作步驟我們就全部講完啦!還有沒看懂或者有關(guān)于Northern Blot實(shí)驗(yàn)操作細(xì)節(jié)要補(bǔ)充的同學(xué)歡迎留言分享給大家哦!