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    實時熒光定量PCR技術答疑由普拉特澤生物技術總結分享。實時熒光定量PCR是普拉特澤生物——表達檢測平臺的常規(guī)實驗，本文主要根據普拉特澤生物承接的所有的熒光定量PCR實驗特殊問題與進行實驗技術咨詢的同學常常提出的問題總結，分享給大家：

1、實時熒光定量技術是什么？有什么用？

    實時熒光定量PCR技術（Real-time qPCR），其基本原理是在常規(guī)PCR基礎上添加熒光染料或熒光染料探針，利用熒光信號積累實時監(jiān)測整個PCR過程。熒光定量PCR最大的優(yōu)勢可以對初始模板進行定量，目前已廣泛應用于生命科學、醫(yī)學研究等領域。
2、CT值是什么？實驗結果沒有CT值怎么回事？

    在相對定量中，Ct值一般控制在15~25之間比較好，如果在絕對定量中，對低拷貝數(shù)的樣品，Ct值會增大，但是一般不宜超過40循環(huán)，否則定量不準確。因此，判斷Ct值出現(xiàn)過晚是否屬于非正常情況，需要根據具體實驗設計和目的進行。可能原因主要是：

    （1）擴增效率低。引物之間或者引物和探針的比例不合適，需要進行優(yōu)化；引物或探針設計不合理，需要重新設計；

    （2）PCR程序不合適，改用三步法進行反應，或者優(yōu)化退火/延伸溫度，可以適當降低退火溫度；退火/延伸時間短（可以在推薦的時間條件下延長10s）；

    （3）MgCl2濃度不合適，增加鎂離子濃度等。PCR各種反應成分的降解或加樣量的不足；

    （4）PCR產物太長。PCR產物設計超過500bp；

    （5）模板中存在抑制物。用高純度模板進行PCR檢測或將模板進行稀釋。

3、我的熒光定量PCR結果標準曲線線性關系不佳怎么回事？

    如果遇到標準曲線線性關系不佳）的情況，那么很有可能是以下環(huán)節(jié)存在問題：

    （1）標準品稀釋或者加樣存在誤差，吸樣不準，使得標準品不呈梯度；

    （2）標準品出現(xiàn)降解。應避免標準品反復凍融，將高濃度DNA模板分裝，保存于-20℃或-80℃，不要反復凍融，現(xiàn)配現(xiàn)用；

    （3）引物或探針不佳。重新設計更好更穩(wěn)定的引物或探針；

    （4）模板中存在抑制物。模板濃度過高，根據現(xiàn)有商品化熒光定量試劑盒的要求，一般模板量不超過500ng，以50~500ng為宜。

4、為什么我的陰性對照擴增有信號？

    如果陰性對照擴增有信號，首先排查各操作環(huán)節(jié)是否有不當，造成交叉污染：

    （1）引物設計不夠優(yōu)化。應避免引物二聚體和發(fā)夾結構的出現(xiàn)。

    （2）引物濃度不佳。適當降低引物濃度，并注意上下游引物的濃度配比。

    （3）鎂離子濃度過高。適當降低鎂離子濃度，或選擇更適合的mix試劑盒。

    （4）模板有基因組的污染。RNA提取過程中避免基因組DNA的引入，或通過引物設計避免非特異性擴增。

    （5）交叉污染。在所用的試劑中有交叉污染，或操作環(huán)境中有氣溶膠造成污染，建議對操作環(huán)境進行處理，或者更換新的環(huán)境、加樣器、槍頭以及所有的引物、試劑等。

5、為什么我的擴增曲線是S形的？

    如果遇到擴增曲線異常，很有可能是以下環(huán)節(jié)存在問題：

    （1）模板的濃度太高或者降解；

    （2）熒光染料的降解；

    （3）在操作熒光定量PCR時，帶上新的一次性手套，蓋上避免任何指紋或者字跡等；

    （4）液體揮發(fā)。耗材氣密性等問題引起液體蒸發(fā)，沒有很好的聚集在管子里；

    （5）氣泡。操作問題如移液槍加樣引起的氣泡問題。

    好啦，表達檢測平臺常常收到的技術咨詢就是這么多啦，如果您關于熒光定量PCR還有其他的問題或者實驗需要外包歡迎給客服留言，咱們一起學習共勉~