小白也能學(xué)會的細(xì)胞DNA提取步驟
來源/作者:普拉特澤-生物醫(yī)學(xué)整體課題外包平臺
大家好!今天普拉特澤生物繼續(xù)跟大家一起學(xué)習(xí)新的實(shí)驗(yàn)——細(xì)胞DNA提取步驟。
首先我們看看原理——
實(shí)驗(yàn)原理DNA是一種帶有負(fù)電荷的高分子聚合物,在水中溶解度較高,但在異丙醇等有機(jī)溶劑中溶解度較低。當(dāng)細(xì)胞裂解后,DNA在水相中溶解,而蛋白質(zhì)和多糖等其他細(xì)胞成分則在有機(jī)相中溶解。異丙醇加入后,改變了溶液中水分子的排列,減少了水分子與DNA之間的氫鍵作用,使得DNA分子間的相互作用增強(qiáng),從而促使DNA沉淀。另外,異丙醇還能引起蛋白質(zhì)變性,通過破壞蛋白質(zhì)的二級和三級結(jié)構(gòu),減少蛋白質(zhì)與DNA之間的相互作用,使得DNA更容易從蛋白質(zhì)中分離出來。異丙醇提取過程中,許多細(xì)胞內(nèi)的多糖、脂質(zhì)和蛋白質(zhì)等雜質(zhì)會留在水相中,而不與DNA一起沉淀,從而實(shí)現(xiàn)了DNA與這些雜質(zhì)的分離。通過離心可以收集到含有DNA的沉淀,然后使用70%的乙醇進(jìn)行洗滌,以去除殘留的鹽分和有機(jī)溶劑。最后,DNA沉淀被重懸于適當(dāng)?shù)木彌_液中,得到相對純凈的DNA樣品。
2.試劑配制及原理
Tris(三羥甲基氨基甲烷):是一種常用的緩沖劑,能夠維持溶液的pH值相對穩(wěn)定。在細(xì)胞裂解過程中,Tris能夠防止pH變化對酶活性的影響,保護(hù)細(xì)胞內(nèi)的酶和蛋白質(zhì)在裂解過程中不被破壞。EDTA(乙二胺四乙酸):是一種強(qiáng)力的金屬離子螯合劑,能夠與多種金屬離子(如Ca2+、Mg2+、Fe2+等)形成穩(wěn)定的復(fù)合物。在細(xì)胞裂解液中,EDTA可以去除這些金屬離子,防止它們對酶活性的抑制或激活,以及避免金屬離子催化的氧化反應(yīng)損傷蛋白質(zhì)和核酸。
另外,EDTA通過螯合金屬離子,可以抑制一些需要金屬離子作為輔因子的核酸酶的活性,從而保護(hù)DNA和RNA不被降解。SDS(十二烷基硫酸鈉):是一種陰離子表面活性劑,能夠破壞蛋白質(zhì)的二級和三級結(jié)構(gòu),使蛋白質(zhì)變性。同時它能夠與蛋白質(zhì)結(jié)合,形成SDS-蛋白質(zhì)復(fù)合物,增加蛋白質(zhì)在溶液中的溶解度,防止蛋白質(zhì)沉淀。
3實(shí)驗(yàn)步驟 1、裂解細(xì)胞:當(dāng)細(xì)胞匯合度≥60%時,即可提取細(xì)胞的DNA。先吸棄細(xì)胞培養(yǎng)基,加PBS清洗一遍,然后加入胰酶消化,消化完成后加1mL培養(yǎng)基把細(xì)胞吹打下來,將細(xì)胞懸液移至干凈的15mL離心管中,1000rpm,3min離心,棄上清。加入5mL(1個3.5cm皿)細(xì)胞裂解液和50μL蛋白酶K(20mg/mL)吹散細(xì)胞。2、55℃過夜3、加入等體積的異丙醇(5mL),上下顛倒混勻,出現(xiàn)DNA沉淀,用槍頭將DNA沉淀挑至新的Ep管中。(若DNA沉淀較少,則需要離心并棄上清)。4、加入1mL新鮮制備的70%的乙醇,上下顛倒10次以洗滌沉淀,離心,棄上清,把物質(zhì)轉(zhuǎn)移到新的Ep管中。5、空離Ep管,晾干。6、加入100μL ddH2O,65℃,1h,溶解DNA。7、檢測DNA濃度,然后放-20℃保存。
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