EMSA實(shí)驗(yàn)詳細(xì)操作步驟【新人干貨】
來源/作者:普拉特澤-生物醫(yī)學(xué)整體課題外包平臺(tái)
EMSA實(shí)驗(yàn)詳細(xì)操作步驟由普拉特澤生物旗下生物醫(yī)學(xué)科研培訓(xùn)品牌——春風(fēng)學(xué)院總結(jié)分享,快點(diǎn)學(xué)起來吧。普拉特澤生物自建3000平米生物實(shí)驗(yàn)室,專為科研人員提供真實(shí)專業(yè)的生物實(shí)驗(yàn)外包服務(wù)。
1、EMSA實(shí)驗(yàn)前準(zhǔn)備
(1)合理的實(shí)驗(yàn)方案
根據(jù)研究目的合理設(shè)計(jì)特異性探針實(shí)驗(yàn)組以及非特異性探針對(duì)照組,如有必要還可以添加特異性抗體組、特異性核酸競爭組等。
(2)樣本制備
可以選擇提取樣本的總蛋白、核蛋白或者使用純化好的目的蛋白。對(duì)樣本蛋白進(jìn)行定量,實(shí)驗(yàn)中需等量加入蛋白。
(3)探針制備
根據(jù)實(shí)驗(yàn)要求設(shè)計(jì)不同的探針并添加標(biāo)記,可以合成核酸后自行添加,部分已知蛋白有商業(yè)化的抗體也可以直接購買?,F(xiàn)在大多數(shù)實(shí)驗(yàn)室已經(jīng)不再使用放射性標(biāo)記,生物素使用相對(duì)較多。
2、形成蛋白-探針復(fù)合物
(1)在0.5 mL離心管中按順序?qū)⑾铝薪M份混勻:
蛋白樣本(2-5μg) XμL
poly d(I-C) 1μL
Binding Buffer 2μL
Nuclease-Free ddH2O XμL
總體積 9 μl
(2)冰浴5 min后,加入1 μ探針。(對(duì)照組加1ul對(duì)照探針)
(3)PCR儀中室溫(20-23℃)溫育30 min。
3、制備凝膠,電泳
(1)制備6.5%非變性聚丙烯酰胺凝膠:(注意根據(jù)試劑情況按比例調(diào)整總體積)
5XTBE 1 mL
30%Acrylamide/Bis 2.2 mL
deionized,sterilewater 6.62 mL
80%Glycerol 80 μL
10%AP 90 μL
TEMED 10 μL
總體積 10 mL
(2)按標(biāo)準(zhǔn)步驟制備凝膠。
(3)加樣前先在預(yù)冷的0.5X TBE buffer中120V預(yù)電泳10 min,與電泳完畢后沖洗加樣孔。
(4)混合樣本及電泳緩沖液,點(diǎn)樣電泳。
(5)將電泳槽置于冰上或者4℃環(huán)境中,恒壓100V進(jìn)行電泳,直至緩沖液指示帶距離凝膠底部2~3 cm為止。(大約50-60 min,根據(jù)實(shí)際情況調(diào)整電泳時(shí)間及電壓;電泳時(shí)間不宜過長)
4、轉(zhuǎn)膜
(1)在預(yù)冷的0.5XTBE中浸泡凝膠,膜,濾紙和纖維墊。
(2)按如下順序組裝“三明治”:纖維墊,濾紙,凝膠,膜,濾紙,纖維墊。注意電極,確保凝膠位于陰極、膜位于陽極。
(3)在預(yù)冷的0.5XTBE中進(jìn)行轉(zhuǎn)膜。轉(zhuǎn)膜裝置應(yīng)置于冰上或者低溫室中,恒壓60V轉(zhuǎn)膜1h。(注意根據(jù)實(shí)際情況調(diào)整電壓及時(shí)間)。
5、檢測
(1)去除轉(zhuǎn)好的膜,放入合適的盛有緩沖液的容器中,沖洗。(注意整個(gè)檢測過程避免膜干燥)
(2)去掉沖洗緩沖液,加入封閉液后輕微震蕩,室溫封閉20 min。
(3)加入適量的HRP酶標(biāo)記的鏈霉親和素(Streptavidin-HRP conjugate),室溫震蕩孵育45 min。(勿將酶標(biāo)記物直接加到膜上)
(4)去掉酶聯(lián)物稀釋液,用洗滌緩沖液洗膜三次,每次室溫輕微震蕩1 0 min。
(5)配置反應(yīng)底物,均勻加至膜上,室溫孵育5 min。(可以在加完底物后,用薄膜輕輕覆蓋在膜上,使底物均勻覆蓋,注意不要產(chǎn)生氣泡)
(6)化學(xué)發(fā)光成像系統(tǒng)曝光成像(曝光時(shí)間的長短可以根據(jù)檢測方法不同而進(jìn)行相應(yīng)調(diào)整)。
好啦,那關(guān)于EMSA凝膠遷移實(shí)驗(yàn)的詳細(xì)操作步驟就寫到這里啦,如果您還有其他的不懂可以留言和我們的技術(shù)小姐姐交流,更深入的學(xué)習(xí)哦!下期給大家講講EMSA實(shí)驗(yàn)操作過程中的注意事項(xiàng),下期見!